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Des données de comptage de coqs chanteurs sur place de chant sont collectées par les partenaires de l'Observatoire des Galliformes de Montagne chaque année au printemps selon un dispositif d'échantillonnage, que j'ai conçu. Tous les deux ans, j'ajuste à ces données un modèle bayésien de ma conception permettant l'estimation de l'effectif de coqs chanteurs sur le massif à partir de ces données, ainsi que l'estimation des tendances d'évolution de ces effectifs.

Des captures de bouquetin suivis de tests sérologiques ont été menées dans le cadre de la gestion du foyer de brucellose dans le massif du Bargy. Ces captures permettent de connaître le statut sérologique des animaux, avec élimination sélective des animaux séropositifs, et marquage et relâcher des animaux séronégatifs. J'ai développé un modèle permettant d'estimer la séroprévalence dans la population à partir de ces données. Ce modèle tient compte du fait que les captures d’animaux qui servent à cette estimation sont préférentiellement orientées vers les animaux non-marqués. En effet, les animaux marqués dans la population correspondent à des animaux ayant été capturés et testés récemment, puis ayant été relâchés car séronégatifs (les animaux séropositifs étant euthanasiés). Les captures se concentrent alors sur les animaux non encore marqués, dont le statut sérologique n’a encore jamais été contrôlé et qui ont donc plus de chances d’être séropositifs. Or la proportion d’animaux marqués dans la population augmente chaque année (atteignant près de la moitié de la population en 2020). La proportion d’animaux séropositifs parmi les animaux capturés – essentiellement non-marqués – sera donc plus importante que celle de la population.

Je suis auteur et mainteneur des 4 packages pour le logiciel R appartenant à la suite adehabitat. Ces packages permettent l'analyse de l'occupation de l'espace et de la sélection de l'habitat par la faune sauvage, et sont très utilisés par la communauté scientifique travaillant sur les déplacements d'animaux.

L'observatoire national des écosystèmes prairies de fauche s'était donné pour objectif de suivre la qualité de ces écosystèmes à travers l'avifaune prairiale. Avec l'équipe en charge de cet observatoire, je travaille à la conception d'un dispositif d'échantillonnage des prairies de fauche à l'échelle nationale qui puisse permettre de tirer des conclusions concernant les tendances d'évolution de la qualité de ces écosystèmes, qui puisse être décliné à l'échelle nationale.

Le réseau "ongulés sauvages" de l'OFB a pu récolter des données sur les collisions entre ongulés et véhicules à l'échelle de l'unité de gestion, permettant d'identifier les facteurs principaux jouant sur ces collisions à l'aide d'une méthode de sélection de variables bayésienne.